用户在职期间提取公积金，公司是不会知道的。用户提取公积金的记录，只会保留在公积金中心里，公司无法获取用户公积金提取、公积金贷款等信息。而且用户是否提取了公积金，与公司按时缴纳公积金无关，只要用户与公司存在劳动关系，公司就必须为用户缴纳公积金。

另外，用户提取公积金后，公积金账户内的余额会减少，这样会影响后续申请公积金贷款的贷款额度。用户可以选择申请公积金之后再提取公积金，这样既不会影响公积金贷款额度，也可以让用户提取更多的公积金账户余额。甚至，公积金贷款通过贷款审核完成放款后，用户可以全额提取公积金账户内的余额。

用户在职期间，只要满足公积金提取条件，并且有提取公积金的需求，那么就可以办理公积金提取业务。